办理留学手续主要分为三个步骤。
第一步：获得留学学校的入学许可；
第二步：通过学校等机构向日本法务省入境管理局申请、取得“在留资格认定证明书”；
第三步：申请并取得签证。
什么是“留学”在留资格？
所谓的“留学签证”只是习惯叫法，并非正式的签证种类。赴日留学人员在取得“留学”用的“在留资格认定证明书”后，即可申请相应签证。根据2010年7月1日起开始实施的修订版“入国管理法”（日本），留学生的在留资格统一为“留学”，“就学”在留资格已取消。以下为新“在留管理制度”（2012年7月9日起实施）中的“留学”在留资格概要。
在留时间：在留时间最短为三个月，最长为四年三个月。（三个月/六个月/一年/一年三个月/两年/两年三个月/三年/三年三个月/四年/四年三个月）
可否打工：可。获得三个月以上在留资格的留学生，向入国管理局申请到“资格外活动许可”后即可打工。打工有时间限制，原则上每周28小时以内。不可从事色情行业，如违反规定，会被严格处理，也有可能被强制遣返回国。2012年7月9日新 “在留管理制度”实施以后，初次以留学目的入境者可在出入境港口申请“资格外活动许可”。但在留时间为三个月的留学生因不是“在留卡”的发放对象，无法申请“资格外活动许可”，所以不可以打工。
交通费学生折扣：有。留学生可以享受学生折扣，详情请向日本校方确认。
医疗保险：有。获得三个月以上在留资格，并获得“在留卡”的留学生，在日本国内市、町、村相关窗口可办理日本的国民健康保险手续。
在留获得批准后，如何申请签证？
日本留学签证需要通过代办机构申请，签证代办机构名单详见中国各地的日本国驻华使领馆网站。
有关申请签证的各使领馆界定原则上是“所生活的地区”，而不一定是申请人的户口所在地。比如，申请人的户口在重庆，但申请人的居住地或学校在北京，并能提供暂住证或居住证明，即可选一家在北京的代办机构向日本国驻华大使馆领事部（北京）申请。不过个别情况请与代办机构仔细确认后申请。
申请在留资格为“留学”的签证所需材料为：护照/照片/“在留资格认定证明书”原件及复印件/户口本复印件/暂住证或居住证明（申请人户籍不在申请地的领事部或总领事馆管辖范围内时）/签证申请书/留学调查表/经费支付者的在职证明/毕业证书或毕业证书复印件。详情请见：
https://www.cn.emb-japan.go.jp/itpr_zh/visa_shikaku.html。签证申请材料会有变动，请务必在官方网站上确认。
