事业单位按财政供养方式分为全额、差额和自收自支三种类型，在缴纳“五险一金”社保费用的时候，全额、差额事业单位是按机关事业单位工作人员养老保险制度缴纳，自收自支事业单位是按企业养老保险制度缴纳。事业单位分类改革以后，自收自支、生产经营类改企，事业单位统一按机关事业单位养老保险制度缴纳，并轨后按新政策统一执行。
对于差额供给的事业单位来讲，其差额比例是地方政府根据实际情况，核定并定期调节供给比例的。单位可支配收入高，财政供给的比例就少；收入困难，财政供给的比例就高。就拿乡镇卫生院来讲，财政供给20%的有，财政供给95%的也有，即使财政100%供给，也不改变其差额性质。
差额供给的事业单位缴纳社保费用，有三点误区必须澄清：
1、缴纳社保费用的工资基数：不管是全额供给，还是差额供给，事业人员缴纳社保费用的工资基数，都是按计税工资来计算，并非差额供给事业人员要扣除差额部分，只按财政拨款部分计算。个人的实际收入水平，决定了社保费用缴纳的多少，缴的越多，享受的保障数额就越大。
2、缴纳社保费用的比例：全额和差额事业单位养老保险缴费比例都是28%，其中：单位承担20%，个人承担8%。“二金”中职业年金为12%，其中：单位承担8%，个人承担4%。
3、缴纳社保费用的不足部分：事业人员的社保费用，由单位代为扣缴，对于差额单位来讲，如果差额比例过大，缴纳的费用不足时，由个人向单位补足不足部分。
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